Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VTI1AQ96AJ9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VTI1AQ96AJ9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VTI1AQ96AJ9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VTI1AQ96AJ9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VTI1AQ96AJ9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VTI1AQ96AJ9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VTI1AQ96AJ9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VTI1AQ96AJ9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VTI1AQ96AJ9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms