Protein–RNA interactions for Protein: Q92935

EXTL1, Exostosin-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL1Q92935 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EXTL1Q92935 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXTL1Q92935 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms