Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HTRA1Q92743 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTRA1Q92743 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms