Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSPC1Q8WXF1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSPC1Q8WXF1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
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