Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF65

GIPC2, PDZ domain-containing protein GIPC2, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC2Q8TF65 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GIPC2Q8TF65 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GIPC2Q8TF65 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GIPC2Q8TF65 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GIPC2Q8TF65 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GIPC2Q8TF65 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GIPC2Q8TF65 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GIPC2Q8TF65 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GIPC2Q8TF65 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GIPC2Q8TF65 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GIPC2Q8TF65 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GIPC2Q8TF65 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GIPC2Q8TF65 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GIPC2Q8TF65 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GIPC2Q8TF65 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GIPC2Q8TF65 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GIPC2Q8TF65 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GIPC2Q8TF65 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GIPC2Q8TF65 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GIPC2Q8TF65 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GIPC2Q8TF65 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GIPC2Q8TF65 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GIPC2Q8TF65 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GIPC2Q8TF65 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GIPC2Q8TF65 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
GIPC2Q8TF65 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GIPC2Q8TF65 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GIPC2Q8TF65 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms