Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB33

LINC01560, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01560, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01560Q8TB33 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC01560Q8TB33 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC01560Q8TB33 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC01560Q8TB33 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC01560Q8TB33 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC01560Q8TB33 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC01560Q8TB33 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LINC01560Q8TB33 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC01560Q8TB33 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC01560Q8TB33 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC01560Q8TB33 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC01560Q8TB33 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC01560Q8TB33 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms