Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BEST2Q8NFU1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEST2Q8NFU1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms