Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SVOPQ8N4V2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SVOPQ8N4V2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms