Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC6Q8IVU3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HERC6Q8IVU3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERC6Q8IVU3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HERC6Q8IVU3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC6Q8IVU3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC6Q8IVU3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC6Q8IVU3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC6Q8IVU3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC6Q8IVU3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC6Q8IVU3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERC6Q8IVU3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERC6Q8IVU3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERC6Q8IVU3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERC6Q8IVU3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERC6Q8IVU3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERC6Q8IVU3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC6Q8IVU3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC6Q8IVU3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC6Q8IVU3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HERC6Q8IVU3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HERC6Q8IVU3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HERC6Q8IVU3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC6Q8IVU3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms