Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD163Q86VB7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms