Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ALYREFQ86V81 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
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