Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMCO2Q7Z6W1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMCO2Q7Z6W1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMCO2Q7Z6W1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMCO2Q7Z6W1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMCO2Q7Z6W1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMCO2Q7Z6W1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMCO2Q7Z6W1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMCO2Q7Z6W1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMCO2Q7Z6W1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMCO2Q7Z6W1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMCO2Q7Z6W1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMCO2Q7Z6W1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMCO2Q7Z6W1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMCO2Q7Z6W1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMCO2Q7Z6W1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMCO2Q7Z6W1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms