Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00299Q6ZSB3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms