Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTR9Q6PD62 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTR9Q6PD62 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTR9Q6PD62 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTR9Q6PD62 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTR9Q6PD62 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTR9Q6PD62 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTR9Q6PD62 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTR9Q6PD62 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTR9Q6PD62 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTR9Q6PD62 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTR9Q6PD62 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTR9Q6PD62 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTR9Q6PD62 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTR9Q6PD62 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTR9Q6PD62 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTR9Q6PD62 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTR9Q6PD62 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTR9Q6PD62 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTR9Q6PD62 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTR9Q6PD62 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTR9Q6PD62 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTR9Q6PD62 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTR9Q6PD62 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CTR9Q6PD62 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CTR9Q6PD62 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTR9Q6PD62 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTR9Q6PD62 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTR9Q6PD62 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTR9Q6PD62 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTR9Q6PD62 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTR9Q6PD62 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTR9Q6PD62 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTR9Q6PD62 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTR9Q6PD62 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTR9Q6PD62 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTR9Q6PD62 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTR9Q6PD62 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTR9Q6PD62 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTR9Q6PD62 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTR9Q6PD62 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTR9Q6PD62 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTR9Q6PD62 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTR9Q6PD62 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTR9Q6PD62 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTR9Q6PD62 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CTR9Q6PD62 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms