Protein–RNA interactions for Protein: Q68D42

TMEM215, Transmembrane protein 215, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM215Q68D42 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM215Q68D42 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM215Q68D42 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM215Q68D42 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM215Q68D42 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM215Q68D42 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM215Q68D42 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM215Q68D42 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM215Q68D42 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM215Q68D42 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM215Q68D42 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM215Q68D42 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM215Q68D42 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM215Q68D42 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM215Q68D42 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM215Q68D42 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM215Q68D42 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM215Q68D42 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM215Q68D42 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM215Q68D42 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM215Q68D42 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM215Q68D42 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM215Q68D42 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms