Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD39Q53RE8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms