Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC96Q2M329 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC96Q2M329 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms