Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDR2Q16832 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DDR2Q16832 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms