Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCB1Q12824 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCB1Q12824 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCB1Q12824 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCB1Q12824 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCB1Q12824 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCB1Q12824 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCB1Q12824 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCB1Q12824 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCB1Q12824 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCB1Q12824 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCB1Q12824 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCB1Q12824 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCB1Q12824 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCB1Q12824 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCB1Q12824 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCB1Q12824 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCB1Q12824 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCB1Q12824 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCB1Q12824 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCB1Q12824 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCB1Q12824 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCB1Q12824 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCB1Q12824 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCB1Q12824 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCB1Q12824 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCB1Q12824 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCB1Q12824 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCB1Q12824 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCB1Q12824 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCB1Q12824 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCB1Q12824 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCB1Q12824 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCB1Q12824 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCB1Q12824 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCB1Q12824 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCB1Q12824 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCB1Q12824 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCB1Q12824 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCB1Q12824 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCB1Q12824 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCB1Q12824 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCB1Q12824 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCB1Q12824 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCB1Q12824 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCB1Q12824 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCB1Q12824 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCB1Q12824 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCB1Q12824 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMARCB1Q12824 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMARCB1Q12824 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
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