Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SMARCB1Q12824 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCB1Q12824 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCB1Q12824 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCB1Q12824 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCB1Q12824 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
SMARCB1Q12824 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCB1Q12824 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SMARCB1Q12824 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMARCB1Q12824 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SMARCB1Q12824 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SMARCB1Q12824 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCB1Q12824 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMARCB1Q12824 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCB1Q12824 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCB1Q12824 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCB1Q12824 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCB1Q12824 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMARCB1Q12824 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCB1Q12824 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCB1Q12824 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCB1Q12824 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMARCB1Q12824 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCB1Q12824 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SMARCB1Q12824 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCB1Q12824 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCB1Q12824 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SMARCB1Q12824 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SMARCB1Q12824 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SMARCB1Q12824 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SMARCB1Q12824 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SMARCB1Q12824 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCB1Q12824 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SMARCB1Q12824 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SMARCB1Q12824 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SMARCB1Q12824 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SMARCB1Q12824 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SMARCB1Q12824 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCB1Q12824 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SMARCB1Q12824 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCB1Q12824 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCB1Q12824 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCB1Q12824 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCB1Q12824 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMARCB1Q12824 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCB1Q12824 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCB1Q12824 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCB1Q12824 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCB1Q12824 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SMARCB1Q12824 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SMARCB1Q12824 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SMARCB1Q12824 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SMARCB1Q12824 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SMARCB1Q12824 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SMARCB1Q12824 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SMARCB1Q12824 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SMARCB1Q12824 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SMARCB1Q12824 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SMARCB1Q12824 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SMARCB1Q12824 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SMARCB1Q12824 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SMARCB1Q12824 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SMARCB1Q12824 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SMARCB1Q12824 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SMARCB1Q12824 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SMARCB1Q12824 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SMARCB1Q12824 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SMARCB1Q12824 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SMARCB1Q12824 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SMARCB1Q12824 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SMARCB1Q12824 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SMARCB1Q12824 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
SMARCB1Q12824 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SMARCB1Q12824 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SMARCB1Q12824 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SMARCB1Q12824 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SMARCB1Q12824 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SMARCB1Q12824 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SMARCB1Q12824 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SMARCB1Q12824 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SMARCB1Q12824 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SMARCB1Q12824 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SMARCB1Q12824 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SMARCB1Q12824 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCB1Q12824 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SMARCB1Q12824 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SMARCB1Q12824 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SMARCB1Q12824 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SMARCB1Q12824 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SMARCB1Q12824 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCB1Q12824 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCB1Q12824 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCB1Q12824 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCB1Q12824 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCB1Q12824 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SMARCB1Q12824 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SMARCB1Q12824 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SMARCB1Q12824 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMARCB1Q12824 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMARCB1Q12824 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
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