Protein–RNA interactions for Protein: Q07444

KLRC3, NKG2-E type II integral membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRC3Q07444 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
KLRC3Q07444 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLRC3Q07444 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KLRC3Q07444 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KLRC3Q07444 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KLRC3Q07444 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KLRC3Q07444 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KLRC3Q07444 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KLRC3Q07444 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KLRC3Q07444 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KLRC3Q07444 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KLRC3Q07444 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KLRC3Q07444 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
KLRC3Q07444 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KLRC3Q07444 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KLRC3Q07444 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KLRC3Q07444 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KLRC3Q07444 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KLRC3Q07444 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KLRC3Q07444 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KLRC3Q07444 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KLRC3Q07444 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KLRC3Q07444 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KLRC3Q07444 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KLRC3Q07444 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLRC3Q07444 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLRC3Q07444 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLRC3Q07444 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLRC3Q07444 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLRC3Q07444 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KLRC3Q07444 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLRC3Q07444 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLRC3Q07444 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLRC3Q07444 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLRC3Q07444 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLRC3Q07444 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLRC3Q07444 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLRC3Q07444 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLRC3Q07444 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLRC3Q07444 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLRC3Q07444 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms