Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE4BQ07343 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE4BQ07343 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms