Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms