Protein–RNA interactions for Protein: P61073

CXCR4, C-X-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR4P61073 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CXCR4P61073 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CXCR4P61073 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCR4P61073 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCR4P61073 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCR4P61073 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCR4P61073 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCR4P61073 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCR4P61073 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.4 ms