Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVFRD-1P60508 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms