Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA4P54764 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHA4P54764 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms