Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRCC3P46736 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRCC3P46736 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms