Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
BRCC3P46736 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
BRCC3P46736 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
BRCC3P46736 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BRCC3P46736 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
BRCC3P46736 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
BRCC3P46736 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
BRCC3P46736 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
BRCC3P46736 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
BRCC3P46736 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
BRCC3P46736 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
BRCC3P46736 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
BRCC3P46736 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
BRCC3P46736 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
BRCC3P46736 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
BRCC3P46736 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
BRCC3P46736 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
BRCC3P46736 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
BRCC3P46736 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BRCC3P46736 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
BRCC3P46736 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BRCC3P46736 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
BRCC3P46736 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BRCC3P46736 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
BRCC3P46736 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
BRCC3P46736 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
BRCC3P46736 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BRCC3P46736 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BRCC3P46736 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
BRCC3P46736 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
BRCC3P46736 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BRCC3P46736 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
BRCC3P46736 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
BRCC3P46736 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
BRCC3P46736 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
BRCC3P46736 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BRCC3P46736 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
BRCC3P46736 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
BRCC3P46736 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
BRCC3P46736 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
BRCC3P46736 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
BRCC3P46736 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
BRCC3P46736 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
BRCC3P46736 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
BRCC3P46736 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
BRCC3P46736 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
BRCC3P46736 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
BRCC3P46736 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
BRCC3P46736 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BRCC3P46736 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
BRCC3P46736 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
BRCC3P46736 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BRCC3P46736 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
BRCC3P46736 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
BRCC3P46736 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
BRCC3P46736 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
BRCC3P46736 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
BRCC3P46736 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
BRCC3P46736 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
BRCC3P46736 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRCC3P46736 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BRCC3P46736 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
BRCC3P46736 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
BRCC3P46736 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
BRCC3P46736 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
BRCC3P46736 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
BRCC3P46736 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
BRCC3P46736 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
BRCC3P46736 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
BRCC3P46736 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
BRCC3P46736 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
BRCC3P46736 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
BRCC3P46736 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
BRCC3P46736 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
BRCC3P46736 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
BRCC3P46736 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
BRCC3P46736 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
BRCC3P46736 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
BRCC3P46736 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
BRCC3P46736 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
BRCC3P46736 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
BRCC3P46736 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
BRCC3P46736 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
BRCC3P46736 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
BRCC3P46736 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
BRCC3P46736 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
BRCC3P46736 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
BRCC3P46736 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
BRCC3P46736 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
BRCC3P46736 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
BRCC3P46736 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
BRCC3P46736 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
BRCC3P46736 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
BRCC3P46736 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
BRCC3P46736 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
BRCC3P46736 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
BRCC3P46736 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
BRCC3P46736 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
BRCC3P46736 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
BRCC3P46736 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms