Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MCAMP43121 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MCAMP43121 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MCAMP43121 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MCAMP43121 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MCAMP43121 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
MCAMP43121 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCAMP43121 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCAMP43121 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
MCAMP43121 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCAMP43121 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCAMP43121 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCAMP43121 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCAMP43121 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCAMP43121 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCAMP43121 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MCAMP43121 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MCAMP43121 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MCAMP43121 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MCAMP43121 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MCAMP43121 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MCAMP43121 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MCAMP43121 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MCAMP43121 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MCAMP43121 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MCAMP43121 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MCAMP43121 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MCAMP43121 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MCAMP43121 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MCAMP43121 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MCAMP43121 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MCAMP43121 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MCAMP43121 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MCAMP43121 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MCAMP43121 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MCAMP43121 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MCAMP43121 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MCAMP43121 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MCAMP43121 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MCAMP43121 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
MCAMP43121 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MCAMP43121 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MCAMP43121 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MCAMP43121 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MCAMP43121 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MCAMP43121 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MCAMP43121 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MCAMP43121 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MCAMP43121 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MCAMP43121 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MCAMP43121 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MCAMP43121 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MCAMP43121 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MCAMP43121 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MCAMP43121 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MCAMP43121 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
MCAMP43121 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MCAMP43121 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MCAMP43121 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MCAMP43121 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MCAMP43121 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MCAMP43121 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MCAMP43121 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MCAMP43121 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MCAMP43121 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MCAMP43121 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MCAMP43121 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MCAMP43121 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MCAMP43121 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MCAMP43121 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MCAMP43121 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
MCAMP43121 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MCAMP43121 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MCAMP43121 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MCAMP43121 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MCAMP43121 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MCAMP43121 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MCAMP43121 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MCAMP43121 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MCAMP43121 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MCAMP43121 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
MCAMP43121 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MCAMP43121 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MCAMP43121 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MCAMP43121 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MCAMP43121 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MCAMP43121 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MCAMP43121 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MCAMP43121 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCAMP43121 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCAMP43121 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCAMP43121 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCAMP43121 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
MCAMP43121 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCAMP43121 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCAMP43121 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCAMP43121 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCAMP43121 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCAMP43121 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCAMP43121 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms