Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC1A4P43007 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC1A4P43007 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms