Protein–RNA interactions for Protein: P41247

PNPLA4, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA4P41247 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNPLA4P41247 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNPLA4P41247 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNPLA4P41247 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNPLA4P41247 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNPLA4P41247 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNPLA4P41247 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNPLA4P41247 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNPLA4P41247 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNPLA4P41247 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNPLA4P41247 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PNPLA4P41247 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNPLA4P41247 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNPLA4P41247 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNPLA4P41247 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNPLA4P41247 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNPLA4P41247 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNPLA4P41247 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNPLA4P41247 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNPLA4P41247 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNPLA4P41247 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PNPLA4P41247 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PNPLA4P41247 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNPLA4P41247 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms