Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CLCN1P35523 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLCN1P35523 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms