Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMOD1P29536 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMOD1P29536 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMOD1P29536 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMOD1P29536 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMOD1P29536 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMOD1P29536 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
LMOD1P29536 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMOD1P29536 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMOD1P29536 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMOD1P29536 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMOD1P29536 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD1P29536 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD1P29536 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD1P29536 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD1P29536 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD1P29536 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD1P29536 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD1P29536 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMOD1P29536 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMOD1P29536 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMOD1P29536 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMOD1P29536 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
LMOD1P29536 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMOD1P29536 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms