Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDCP19113 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDCP19113 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDCP19113 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDCP19113 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HDCP19113 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDCP19113 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDCP19113 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDCP19113 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HDCP19113 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDCP19113 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDCP19113 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDCP19113 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDCP19113 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDCP19113 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDCP19113 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDCP19113 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDCP19113 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDCP19113 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDCP19113 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDCP19113 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDCP19113 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDCP19113 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDCP19113 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDCP19113 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDCP19113 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDCP19113 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDCP19113 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HDCP19113 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDCP19113 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HDCP19113 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDCP19113 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDCP19113 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDCP19113 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDCP19113 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDCP19113 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDCP19113 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDCP19113 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDCP19113 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HDCP19113 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDCP19113 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDCP19113 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDCP19113 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDCP19113 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDCP19113 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDCP19113 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDCP19113 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDCP19113 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDCP19113 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDCP19113 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HDCP19113 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDCP19113 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDCP19113 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDCP19113 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDCP19113 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDCP19113 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDCP19113 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDCP19113 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDCP19113 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDCP19113 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HDCP19113 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDCP19113 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HDCP19113 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDCP19113 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDCP19113 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDCP19113 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDCP19113 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDCP19113 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDCP19113 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDCP19113 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDCP19113 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDCP19113 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HDCP19113 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDCP19113 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDCP19113 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDCP19113 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDCP19113 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDCP19113 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDCP19113 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDCP19113 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDCP19113 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HDCP19113 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDCP19113 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDCP19113 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDCP19113 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDCP19113 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDCP19113 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HDCP19113 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDCP19113 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDCP19113 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDCP19113 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDCP19113 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDCP19113 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HDCP19113 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDCP19113 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDCP19113 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDCP19113 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDCP19113 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDCP19113 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDCP19113 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms