Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF6P18850 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF6P18850 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF6P18850 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF6P18850 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF6P18850 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF6P18850 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF6P18850 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF6P18850 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF6P18850 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF6P18850 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF6P18850 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF6P18850 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF6P18850 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF6P18850 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF6P18850 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF6P18850 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF6P18850 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF6P18850 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF6P18850 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF6P18850 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF6P18850 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF6P18850 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF6P18850 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF6P18850 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF6P18850 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF6P18850 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF6P18850 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF6P18850 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF6P18850 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF6P18850 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF6P18850 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF6P18850 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF6P18850 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF6P18850 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF6P18850 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF6P18850 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF6P18850 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF6P18850 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF6P18850 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF6P18850 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF6P18850 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF6P18850 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF6P18850 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF6P18850 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF6P18850 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF6P18850 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF6P18850 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF6P18850 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF6P18850 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF6P18850 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATF6P18850 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF6P18850 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF6P18850 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF6P18850 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF6P18850 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF6P18850 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF6P18850 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF6P18850 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF6P18850 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF6P18850 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF6P18850 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF6P18850 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF6P18850 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF6P18850 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF6P18850 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF6P18850 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF6P18850 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF6P18850 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF6P18850 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF6P18850 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF6P18850 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF6P18850 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF6P18850 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF6P18850 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF6P18850 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF6P18850 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF6P18850 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF6P18850 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF6P18850 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF6P18850 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF6P18850 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF6P18850 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATF6P18850 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF6P18850 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF6P18850 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF6P18850 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF6P18850 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF6P18850 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF6P18850 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF6P18850 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF6P18850 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF6P18850 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF6P18850 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF6P18850 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF6P18850 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF6P18850 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF6P18850 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF6P18850 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF6P18850 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms