Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ATF6P18850 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ATF6P18850 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ATF6P18850 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ATF6P18850 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ATF6P18850 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ATF6P18850 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
ATF6P18850 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ATF6P18850 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATF6P18850 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATF6P18850 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ATF6P18850 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATF6P18850 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATF6P18850 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATF6P18850 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATF6P18850 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
ATF6P18850 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ATF6P18850 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ATF6P18850 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ATF6P18850 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATF6P18850 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATF6P18850 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ATF6P18850 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATF6P18850 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATF6P18850 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ATF6P18850 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ATF6P18850 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ATF6P18850 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ATF6P18850 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ATF6P18850 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATF6P18850 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATF6P18850 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ATF6P18850 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ATF6P18850 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ATF6P18850 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ATF6P18850 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ATF6P18850 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATF6P18850 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATF6P18850 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
ATF6P18850 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATF6P18850 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ATF6P18850 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ATF6P18850 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
ATF6P18850 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATF6P18850 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATF6P18850 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32■■■□□ 2.71
ATF6P18850 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ATF6P18850 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ATF6P18850 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ATF6P18850 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
ATF6P18850 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
ATF6P18850 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ATF6P18850 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATF6P18850 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATF6P18850 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATF6P18850 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ATF6P18850 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ATF6P18850 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ATF6P18850 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ATF6P18850 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ATF6P18850 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ATF6P18850 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATF6P18850 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ATF6P18850 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ATF6P18850 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ATF6P18850 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ATF6P18850 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ATF6P18850 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ATF6P18850 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
ATF6P18850 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATF6P18850 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATF6P18850 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ATF6P18850 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ATF6P18850 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATF6P18850 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATF6P18850 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ATF6P18850 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATF6P18850 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATF6P18850 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATF6P18850 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATF6P18850 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATF6P18850 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATF6P18850 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATF6P18850 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATF6P18850 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATF6P18850 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATF6P18850 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATF6P18850 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATF6P18850 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATF6P18850 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATF6P18850 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATF6P18850 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
ATF6P18850 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATF6P18850 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATF6P18850 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATF6P18850 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATF6P18850 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATF6P18850 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATF6P18850 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATF6P18850 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms