Protein–RNA interactions for Protein: P17858

PFKL, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKLP17858 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFKLP17858 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFKLP17858 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PFKLP17858 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFKLP17858 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFKLP17858 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFKLP17858 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFKLP17858 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFKLP17858 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFKLP17858 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PFKLP17858 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PFKLP17858 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PFKLP17858 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PFKLP17858 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PFKLP17858 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PFKLP17858 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PFKLP17858 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PFKLP17858 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PFKLP17858 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PFKLP17858 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PFKLP17858 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PFKLP17858 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFKLP17858 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFKLP17858 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFKLP17858 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFKLP17858 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFKLP17858 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFKLP17858 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFKLP17858 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFKLP17858 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PFKLP17858 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFKLP17858 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKLP17858 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKLP17858 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKLP17858 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKLP17858 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKLP17858 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKLP17858 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFKLP17858 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PFKLP17858 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFKLP17858 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFKLP17858 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PFKLP17858 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFKLP17858 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFKLP17858 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFKLP17858 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFKLP17858 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFKLP17858 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFKLP17858 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFKLP17858 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFKLP17858 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFKLP17858 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFKLP17858 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFKLP17858 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFKLP17858 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFKLP17858 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFKLP17858 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFKLP17858 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFKLP17858 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFKLP17858 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFKLP17858 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFKLP17858 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PFKLP17858 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFKLP17858 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFKLP17858 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFKLP17858 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PFKLP17858 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PFKLP17858 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PFKLP17858 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PFKLP17858 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PFKLP17858 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PFKLP17858 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PFKLP17858 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PFKLP17858 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PFKLP17858 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PFKLP17858 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PFKLP17858 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PFKLP17858 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PFKLP17858 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFKLP17858 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PFKLP17858 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFKLP17858 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFKLP17858 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PFKLP17858 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFKLP17858 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFKLP17858 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFKLP17858 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFKLP17858 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PFKLP17858 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PFKLP17858 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PFKLP17858 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PFKLP17858 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PFKLP17858 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFKLP17858 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFKLP17858 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFKLP17858 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFKLP17858 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFKLP17858 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFKLP17858 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFKLP17858 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms