Protein–RNA interactions for Protein: P13349

MYF5, Myogenic factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF5P13349 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYF5P13349 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYF5P13349 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYF5P13349 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYF5P13349 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYF5P13349 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYF5P13349 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYF5P13349 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYF5P13349 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYF5P13349 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYF5P13349 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYF5P13349 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYF5P13349 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYF5P13349 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYF5P13349 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYF5P13349 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYF5P13349 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYF5P13349 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYF5P13349 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYF5P13349 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYF5P13349 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYF5P13349 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYF5P13349 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYF5P13349 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYF5P13349 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYF5P13349 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYF5P13349 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MYF5P13349 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYF5P13349 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYF5P13349 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MYF5P13349 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MYF5P13349 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYF5P13349 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYF5P13349 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MYF5P13349 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MYF5P13349 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYF5P13349 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYF5P13349 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYF5P13349 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYF5P13349 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MYF5P13349 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYF5P13349 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYF5P13349 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYF5P13349 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYF5P13349 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MYF5P13349 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYF5P13349 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYF5P13349 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYF5P13349 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYF5P13349 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYF5P13349 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYF5P13349 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYF5P13349 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYF5P13349 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYF5P13349 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYF5P13349 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYF5P13349 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MYF5P13349 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYF5P13349 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYF5P13349 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYF5P13349 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYF5P13349 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYF5P13349 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYF5P13349 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYF5P13349 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYF5P13349 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYF5P13349 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYF5P13349 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYF5P13349 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYF5P13349 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYF5P13349 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYF5P13349 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYF5P13349 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYF5P13349 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYF5P13349 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYF5P13349 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYF5P13349 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYF5P13349 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYF5P13349 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYF5P13349 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYF5P13349 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYF5P13349 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYF5P13349 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYF5P13349 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYF5P13349 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYF5P13349 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYF5P13349 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYF5P13349 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYF5P13349 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYF5P13349 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYF5P13349 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYF5P13349 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYF5P13349 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYF5P13349 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYF5P13349 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYF5P13349 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYF5P13349 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYF5P13349 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MYF5P13349 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYF5P13349 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms