Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
PLXNC1O60486 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PLXNC1O60486 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PLXNC1O60486 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PLXNC1O60486 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PLXNC1O60486 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PLXNC1O60486 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
PLXNC1O60486 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.46
PLXNC1O60486 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
PLXNC1O60486 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PLXNC1O60486 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
PLXNC1O60486 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PLXNC1O60486 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
PLXNC1O60486 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PLXNC1O60486 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PLXNC1O60486 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PLXNC1O60486 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PLXNC1O60486 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PLXNC1O60486 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PLXNC1O60486 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PLXNC1O60486 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PLXNC1O60486 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PLXNC1O60486 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PLXNC1O60486 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
PLXNC1O60486 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PLXNC1O60486 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
PLXNC1O60486 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PLXNC1O60486 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PLXNC1O60486 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
PLXNC1O60486 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PLXNC1O60486 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PLXNC1O60486 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PLXNC1O60486 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PLXNC1O60486 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PLXNC1O60486 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PLXNC1O60486 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PLXNC1O60486 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PLXNC1O60486 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PLXNC1O60486 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PLXNC1O60486 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PLXNC1O60486 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PLXNC1O60486 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PLXNC1O60486 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PLXNC1O60486 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PLXNC1O60486 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PLXNC1O60486 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms