Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC52.13■■■■■ 5.94
PLXNC1O60486 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC51.94■■■■■ 5.91
PLXNC1O60486 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.23■■■■■ 5.79
PLXNC1O60486 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.94■■■■■ 5.74
PLXNC1O60486 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.48■■■■■ 5.67
PLXNC1O60486 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.25■■■■■ 5.63
PLXNC1O60486 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.23■■■■■ 5.63
PLXNC1O60486 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC49.93■■■■■ 5.58
PLXNC1O60486 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.57■■■■■ 5.53
PLXNC1O60486 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC49.49■■■■■ 5.51
PLXNC1O60486 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.36■■■■■ 5.49
PLXNC1O60486 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC49.32■■■■■ 5.49
PLXNC1O60486 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC49.27■■■■■ 5.48
PLXNC1O60486 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC49.14■■■■■ 5.46
PLXNC1O60486 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.89■■■■■ 5.42
PLXNC1O60486 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
PLXNC1O60486 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.76■■■■■ 5.4
PLXNC1O60486 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.73■■■■■ 5.39
PLXNC1O60486 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC48.52■■■■■ 5.36
PLXNC1O60486 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.51■■■■■ 5.36
PLXNC1O60486 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.06■■■■■ 5.28
PLXNC1O60486 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
PLXNC1O60486 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
PLXNC1O60486 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC47.99■■■■■ 5.27
PLXNC1O60486 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
PLXNC1O60486 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
PLXNC1O60486 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.85■■■■■ 5.25
PLXNC1O60486 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC47.83■■■■■ 5.25
PLXNC1O60486 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
PLXNC1O60486 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC47.7■■■■■ 5.23
PLXNC1O60486 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC47.55■■■■■ 5.2
PLXNC1O60486 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.55■■■■■ 5.2
PLXNC1O60486 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC47.32■■■■■ 5.17
PLXNC1O60486 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC47.32■■■■■ 5.17
PLXNC1O60486 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC47.32■■■■■ 5.17
PLXNC1O60486 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
PLXNC1O60486 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC46.9■■■■■ 5.1
PLXNC1O60486 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC46.86■■■■■ 5.09
PLXNC1O60486 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
PLXNC1O60486 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
PLXNC1O60486 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC46.51■■■■■ 5.04
PLXNC1O60486 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.02
PLXNC1O60486 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
PLXNC1O60486 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC46.31■■■■■ 5
PLXNC1O60486 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC46.26■■■■■ 5
PLXNC1O60486 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
PLXNC1O60486 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
PLXNC1O60486 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
PLXNC1O60486 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
PLXNC1O60486 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC45.91■■■■■ 4.94
PLXNC1O60486 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
PLXNC1O60486 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.94
PLXNC1O60486 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC45.79■■■■■ 4.92
PLXNC1O60486 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC45.76■■■■■ 4.92
PLXNC1O60486 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
PLXNC1O60486 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.71■■■■■ 4.91
PLXNC1O60486 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
PLXNC1O60486 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
PLXNC1O60486 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC45.58■■■■■ 4.89
PLXNC1O60486 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
PLXNC1O60486 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
PLXNC1O60486 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
PLXNC1O60486 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC45.5■■■■■ 4.87
PLXNC1O60486 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
PLXNC1O60486 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.28■■■■■ 4.84
PLXNC1O60486 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
PLXNC1O60486 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.27■■■■■ 4.84
PLXNC1O60486 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
PLXNC1O60486 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
PLXNC1O60486 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
PLXNC1O60486 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
PLXNC1O60486 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
PLXNC1O60486 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.14■■■■■ 4.82
PLXNC1O60486 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
PLXNC1O60486 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.81
PLXNC1O60486 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
PLXNC1O60486 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
PLXNC1O60486 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC44.95■■■■■ 4.79
PLXNC1O60486 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.95■■■■■ 4.79
PLXNC1O60486 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
PLXNC1O60486 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC44.94■■■■■ 4.79
PLXNC1O60486 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC44.94■■■■■ 4.78
PLXNC1O60486 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC44.93■■■■■ 4.78
PLXNC1O60486 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
PLXNC1O60486 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC44.92■■■■■ 4.78
PLXNC1O60486 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC44.9■■■■■ 4.78
PLXNC1O60486 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.87■■■■■ 4.77
PLXNC1O60486 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC44.87■■■■■ 4.77
PLXNC1O60486 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.84■■■■■ 4.77
PLXNC1O60486 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
PLXNC1O60486 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
PLXNC1O60486 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
PLXNC1O60486 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
PLXNC1O60486 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC44.77■■■■■ 4.76
PLXNC1O60486 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
PLXNC1O60486 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC44.59■■■■■ 4.73
PLXNC1O60486 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
PLXNC1O60486 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC44.59■■■■■ 4.73
PLXNC1O60486 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC44.57■■■■■ 4.73
PLXNC1O60486 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC44.57■■■■■ 4.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms