Protein–RNA interactions for Protein: O00712

NFIB, Nuclear factor 1 B-type, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIBO00712 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFIBO00712 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFIBO00712 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFIBO00712 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFIBO00712 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFIBO00712 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFIBO00712 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFIBO00712 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFIBO00712 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFIBO00712 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFIBO00712 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFIBO00712 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFIBO00712 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFIBO00712 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFIBO00712 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFIBO00712 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFIBO00712 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFIBO00712 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFIBO00712 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFIBO00712 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFIBO00712 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFIBO00712 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFIBO00712 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFIBO00712 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFIBO00712 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFIBO00712 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFIBO00712 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NFIBO00712 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFIBO00712 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFIBO00712 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFIBO00712 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFIBO00712 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NFIBO00712 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFIBO00712 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFIBO00712 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NFIBO00712 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFIBO00712 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NFIBO00712 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFIBO00712 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFIBO00712 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFIBO00712 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFIBO00712 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFIBO00712 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFIBO00712 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFIBO00712 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NFIBO00712 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFIBO00712 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIBO00712 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIBO00712 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIBO00712 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIBO00712 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIBO00712 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIBO00712 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFIBO00712 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFIBO00712 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFIBO00712 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFIBO00712 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFIBO00712 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFIBO00712 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFIBO00712 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFIBO00712 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFIBO00712 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NFIBO00712 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFIBO00712 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFIBO00712 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFIBO00712 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFIBO00712 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFIBO00712 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFIBO00712 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NFIBO00712 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFIBO00712 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFIBO00712 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFIBO00712 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFIBO00712 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NFIBO00712 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFIBO00712 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFIBO00712 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFIBO00712 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFIBO00712 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NFIBO00712 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NFIBO00712 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFIBO00712 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFIBO00712 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFIBO00712 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFIBO00712 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFIBO00712 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFIBO00712 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFIBO00712 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFIBO00712 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFIBO00712 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFIBO00712 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFIBO00712 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFIBO00712 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NFIBO00712 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFIBO00712 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFIBO00712 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFIBO00712 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFIBO00712 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFIBO00712 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFIBO00712 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms