Protein–RNA interactions for Protein: O00712

NFIB, Nuclear factor 1 B-type, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIBO00712 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.64■■■■□ 3.94
NFIBO00712 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
NFIBO00712 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
NFIBO00712 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
NFIBO00712 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
NFIBO00712 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
NFIBO00712 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
NFIBO00712 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
NFIBO00712 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NFIBO00712 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NFIBO00712 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
NFIBO00712 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
NFIBO00712 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NFIBO00712 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NFIBO00712 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
NFIBO00712 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NFIBO00712 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NFIBO00712 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NFIBO00712 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NFIBO00712 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NFIBO00712 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NFIBO00712 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NFIBO00712 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NFIBO00712 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NFIBO00712 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NFIBO00712 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NFIBO00712 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NFIBO00712 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
NFIBO00712 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NFIBO00712 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NFIBO00712 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NFIBO00712 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NFIBO00712 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NFIBO00712 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NFIBO00712 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NFIBO00712 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NFIBO00712 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NFIBO00712 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NFIBO00712 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
NFIBO00712 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NFIBO00712 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NFIBO00712 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NFIBO00712 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NFIBO00712 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
NFIBO00712 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NFIBO00712 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
NFIBO00712 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.17
NFIBO00712 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NFIBO00712 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
NFIBO00712 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NFIBO00712 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NFIBO00712 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NFIBO00712 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NFIBO00712 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NFIBO00712 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NFIBO00712 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NFIBO00712 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NFIBO00712 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NFIBO00712 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NFIBO00712 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NFIBO00712 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NFIBO00712 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NFIBO00712 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NFIBO00712 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NFIBO00712 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NFIBO00712 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NFIBO00712 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NFIBO00712 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NFIBO00712 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
NFIBO00712 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NFIBO00712 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NFIBO00712 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NFIBO00712 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NFIBO00712 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NFIBO00712 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NFIBO00712 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NFIBO00712 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
NFIBO00712 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NFIBO00712 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
NFIBO00712 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
NFIBO00712 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NFIBO00712 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NFIBO00712 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NFIBO00712 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NFIBO00712 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NFIBO00712 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NFIBO00712 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NFIBO00712 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NFIBO00712 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NFIBO00712 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NFIBO00712 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
NFIBO00712 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NFIBO00712 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NFIBO00712 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NFIBO00712 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NFIBO00712 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NFIBO00712 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NFIBO00712 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NFIBO00712 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NFIBO00712 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms