Protein–RNA interactions for Protein: A6NKU9

SPDYE3, Speedy protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE3A6NKU9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPDYE3A6NKU9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SPDYE3A6NKU9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms