Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVFC1-1P60608 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms