Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 USB1-212ENST00000566082 3888 ntTSL 212.32□□□□□ -0.445e-10■■□□□ 14.3
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GTF2F1P35269 PPP4R1-220ENST00000581835 379 ntTSL 211.32□□□□□ -0.68e-7■■□□□ 14.3
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GTF2F1P35269 CREB1-216ENST00000494094 580 ntTSL 27.26□□□□□ -1.257e-8■■□□□ 14.3
GTF2F1P35269 CREB1-207ENST00000445803 651 ntTSL 44.3□□□□□ -1.727e-8■■□□□ 14.3
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GTF2F1P35269 RING1-202ENST00000478431 1532 ntTSL 1 (best)25.88■■□□□ 1.733e-7■■□□□ 14.3
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GTF2F1P35269 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.431e-7■■□□□ 14.3
GTF2F1P35269 Z97192.3-201ENST00000420902 2975 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.042e-6■■□□□ 14.2
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GTF2F1P35269 IQGAP3-203ENST00000491900 5294 ntTSL 1 (best)13.17□□□□□ -0.31e-7■■□□□ 14.2
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GTF2F1P35269 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.033e-6■■□□□ 14.2
GTF2F1P35269 SDR39U1-203ENST00000544691 1507 ntTSL 1 (best)20.96■□□□□ 0.953e-6■■□□□ 14.2
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GTF2F1P35269 SDR39U1-215ENST00000555830 418 ntTSL 317.22■□□□□ 0.353e-6■■□□□ 14.2
GTF2F1P35269 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.263e-6■■□□□ 14.2
GTF2F1P35269 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.163e-6■■□□□ 14.2
GTF2F1P35269 SDR39U1-211ENST00000555355 934 ntTSL 215.85■□□□□ 0.133e-6■■□□□ 14.2
GTF2F1P35269 SDR39U1-214ENST00000555778 608 ntTSL 215.48■□□□□ 0.073e-6■■□□□ 14.2
GTF2F1P35269 RNASE4-201ENST00000397995 853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.583e-6■■□□□ 14.2
GTF2F1P35269 ANG-203ENST00000554073 251 ntTSL 33.78□□□□□ -1.83e-6■■□□□ 14.2
GTF2F1P35269 TRIM28-204ENST00000594806 861 ntTSL 527.84■■■□□ 2.051e-6■■□□□ 14.1
GTF2F1P35269 TRIM28-203ENST00000593582 533 ntTSL 316.92■□□□□ 0.31e-6■■□□□ 14.1
GTF2F1P35269 SH3BP4-209ENST00000484097 612 ntTSL 221.13■□□□□ 0.979e-7■■□□□ 14.1
GTF2F1P35269 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.191e-6■■□□□ 14.1
GTF2F1P35269 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.651e-6■■□□□ 14.1
GTF2F1P35269 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.11e-6■■□□□ 14.1
GTF2F1P35269 LYRM1-210ENST00000568820 1695 ntTSL 1 (best)12.36□□□□□ -0.431e-6■■□□□ 14.1
GTF2F1P35269 LYRM1-207ENST00000567165 931 ntTSL 1 (best)12.29□□□□□ -0.441e-6■■□□□ 14.1
GTF2F1P35269 LYRM1-204ENST00000439021 1558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.541e-6■■□□□ 14.1
GTF2F1P35269 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.421e-6■■□□□ 14.1
GTF2F1P35269 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.854e-6■■□□□ 14.1
GTF2F1P35269 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.084e-6■■□□□ 14.1
GTF2F1P35269 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.084e-6■■□□□ 14.1
GTF2F1P35269 UBE2V1-203ENST00000371674 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.184e-6■■□□□ 14.1
GTF2F1P35269 UBE2V1-206ENST00000415862 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.424e-6■■□□□ 14.1
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