RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492871.5

GUK1-234, Transcript of guanylate kinase 1, humanhuman

TSL 3

Gene GUK1, Length 1,065 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GUK1-234ENST00000492871 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.59■■■■■ 7.77
GUK1-234ENST00000492871 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.74■■■■■ 6.67
GUK1-234ENST00000492871 ABCC9O60706 1549 aa55.82■■■■■ 6.53
GUK1-234ENST00000492871 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.59■■■■■ 6.17
GUK1-234ENST00000492871 NACADO15069 1562 aa53.47■■■■■ 6.15
GUK1-234ENST00000492871 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.13■■■■■ 6.1
GUK1-234ENST00000492871 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.1■■■■■ 6.09
GUK1-234ENST00000492871 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.9■■■■■ 6.06
GUK1-234ENST00000492871 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.69■■■■■ 6.03
GUK1-234ENST00000492871 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.26■■■■■ 5.96
GUK1-234ENST00000492871 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.05■■■■■ 5.92
GUK1-234ENST00000492871 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.96■■■■■ 5.91
GUK1-234ENST00000492871 SCRIBQ14160 1630 aa51.63■■■■■ 5.86
GUK1-234ENST00000492871 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.59■■■■■ 5.85
GUK1-234ENST00000492871 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.54■■■■■ 5.84
GUK1-234ENST00000492871 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.64■■■■■ 5.7
GUK1-234ENST00000492871 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.5■■■■■ 5.67
GUK1-234ENST00000492871 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.26■■■■■ 5.64
GUK1-234ENST00000492871 SMARCA4P51532 1647 aa49.41■■■■■ 5.5
GUK1-234ENST00000492871 NCAPD3P42695 1498 aa49.35■■■■■ 5.49
GUK1-234ENST00000492871 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.33■■■■■ 5.49
GUK1-234ENST00000492871 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.27■■■■■ 5.48
GUK1-234ENST00000492871 SMARCA2P51531 1590 aa49.21■■■■■ 5.47
GUK1-234ENST00000492871 HMGXB3Q12766 1538 aa49.06■■■■■ 5.44
GUK1-234ENST00000492871 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.01■■■■■ 5.44
GUK1-234ENST00000492871 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.95■■■■■ 5.43
GUK1-234ENST00000492871 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.83■■■■■ 5.41
GUK1-234ENST00000492871 WIZO95785 1651 aa48.35■■■■■ 5.33
GUK1-234ENST00000492871 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.28■■■■■ 5.32
GUK1-234ENST00000492871 ERCC6Q03468 1493 aa48.17■■■■■ 5.3
GUK1-234ENST00000492871 NESP48681 1621 aa48.17■■■■■ 5.3
GUK1-234ENST00000492871 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.09■■■■■ 5.29
GUK1-234ENST00000492871 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.91■■■■■ 5.26
GUK1-234ENST00000492871 CUX2O14529 1486 aa47.9■■■■■ 5.26
GUK1-234ENST00000492871 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.86■■■■■ 5.25
GUK1-234ENST00000492871 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.8■■■■■ 5.24
GUK1-234ENST00000492871 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.58■■■■■ 5.21
GUK1-234ENST00000492871 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.57■■■■■ 5.21
GUK1-234ENST00000492871 CFTRP13569 1480 aa47.51■■■■■ 5.2
GUK1-234ENST00000492871 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.32■■■■■ 5.17
GUK1-234ENST00000492871 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.31■■■■■ 5.16
GUK1-234ENST00000492871 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.28■■■■■ 5.16
GUK1-234ENST00000492871 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.27■■■■■ 5.16
GUK1-234ENST00000492871 WDR62O43379 1518 aa47.18■■■■■ 5.14
GUK1-234ENST00000492871 PRDM2Q13029 1718 aa47.02■■■■■ 5.12
GUK1-234ENST00000492871 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.88■■■■■ 5.1
GUK1-234ENST00000492871 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.82■■■■■ 5.09
GUK1-234ENST00000492871 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.6■■■■■ 5.05
GUK1-234ENST00000492871 ABCC8Q09428 1581 aa46.52■■■■■ 5.04
GUK1-234ENST00000492871 TOPBP1Q92547 1522 aa46.48■■■■■ 5.03
GUK1-234ENST00000492871 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.4■■■■■ 5.02
GUK1-234ENST00000492871 IFT140Q96RY7 1462 aa46.33■■■■■ 5.01
GUK1-234ENST00000492871 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.08■■■■■ 4.97
GUK1-234ENST00000492871 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.06■■■■■ 4.96
GUK1-234ENST00000492871 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46■■■■■ 4.95
GUK1-234ENST00000492871 CUX1P39880 1505 aa45.96■■■■■ 4.95
GUK1-234ENST00000492871 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.9■■■■■ 4.94
GUK1-234ENST00000492871 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.87■■■■■ 4.93
GUK1-234ENST00000492871 SOGA1O94964 1423 aa45.86■■■■■ 4.93
GUK1-234ENST00000492871 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.8■■■■■ 4.92
GUK1-234ENST00000492871 OSCARQ8IYS5 282 aa45.79■■■■■ 4.92
GUK1-234ENST00000492871 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.76■■■■■ 4.922e-9■■■■■ 44.3
GUK1-234ENST00000492871 WDR97A6NE52 1622 aa45.71■■■■■ 4.91
GUK1-234ENST00000492871 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.61■■■■■ 4.89
GUK1-234ENST00000492871 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.53■■■■■ 4.88
GUK1-234ENST00000492871 TOP2BQ02880 1626 aa45.48■■■■■ 4.87
GUK1-234ENST00000492871 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.46■■■■■ 4.87
GUK1-234ENST00000492871 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.46■■■■■ 4.87
GUK1-234ENST00000492871 GRIN2BQ13224 1484 aa45.41■■■■■ 4.86
GUK1-234ENST00000492871 SYNJ1O43426 1573 aa45.4■■■■■ 4.86
GUK1-234ENST00000492871 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.36■■■■■ 4.85
GUK1-234ENST00000492871 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.36■■■■■ 4.85
GUK1-234ENST00000492871 CHD1O14646 1710 aa45.34■■■■■ 4.85
GUK1-234ENST00000492871 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.33■■■■■ 4.85
GUK1-234ENST00000492871 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.29■■■■■ 4.84
GUK1-234ENST00000492871 FBLN2P98095 1184 aa45.24■■■■■ 4.83
GUK1-234ENST00000492871 PBRM1Q86U86 1689 aa45.19■■■■■ 4.83
GUK1-234ENST00000492871 SYNJ2O15056 1496 aa45.17■■■■■ 4.82
GUK1-234ENST00000492871 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.13■■■■■ 4.82
GUK1-234ENST00000492871 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.05■■■■■ 4.8
GUK1-234ENST00000492871 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.05■■■■■ 4.8
GUK1-234ENST00000492871 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.05■■■■■ 4.8
GUK1-234ENST00000492871 ARHGEF11O15085 1522 aa45.04■■■■■ 4.8
GUK1-234ENST00000492871 TRIM41Q8WV44 630 aa45.02■■■■■ 4.8
GUK1-234ENST00000492871 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.95■■■■■ 4.79
GUK1-234ENST00000492871 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.91■■■■■ 4.78
GUK1-234ENST00000492871 ADAMTS12P58397 1594 aa44.88■■■■■ 4.78
GUK1-234ENST00000492871 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.82■■■■■ 4.77
GUK1-234ENST00000492871 GRIN2AQ12879 1464 aa44.8■■■■■ 4.76
GUK1-234ENST00000492871 NUP160Q12769 1436 aa44.66■■■■■ 4.74
GUK1-234ENST00000492871 ARAP1Q96P48 1450 aa44.65■■■■■ 4.74
GUK1-234ENST00000492871 KIF27Q86VH2 1401 aa44.64■■■■■ 4.74
GUK1-234ENST00000492871 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.59■■■■■ 4.73
GUK1-234ENST00000492871 CEP170Q5SW79 1584 aa44.56■■■■■ 4.72
GUK1-234ENST00000492871 IGF1RP08069 1367 aa44.49■■■■■ 4.71
GUK1-234ENST00000492871 CUL7Q14999 1698 aa44.4■■■■■ 4.7
GUK1-234ENST00000492871 SHROOM2Q13796 1616 aa44.35■■■■■ 4.69
GUK1-234ENST00000492871 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.23■■■■■ 4.67
GUK1-234ENST00000492871 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.2■■■■■ 4.67
GUK1-234ENST00000492871 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.2■■■■■ 4.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms