Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms