Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms