Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPI1P17947 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPI1P17947 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPI1P17947 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPI1P17947 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPI1P17947 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPI1P17947 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms