Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VBP1P61758 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VBP1P61758 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VBP1P61758 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VBP1P61758 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VBP1P61758 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VBP1P61758 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms